内蒙古草上飞足球俱乐部前身包头市南郊足球俱乐部成立于1998年。在获得2014年中国足球协会业余联赛第10名后，升入2015年中国足球协会乙级联赛。2018年12月24日更名内蒙古草上飞足球俱乐部。